עתודאים אשר למדו תואר במדעי המחשב מצטרפים לשירות הצבאי כשהם מצוידים בידע אקדמי מעמיק בתחום הטכנולוגיה, התכנות, והאלגוריתמיקה.
בצה"ל קיימות מגוון רחב של אפשרויות תפקידים עבורם, המאפשרות ליישם את הידע שלהם בפרויקטים בעלי חשיבות ביטחונית וטכנולוגית גבוהה.

להלן מספר מסלולי שירות מרכזיים:

1. ממר"ם (מרכז המחשבים והמערכות): ממר"ם נחשב לאחד ממוקדי המצוינות הטכנולוגית בצה"ל. עתודאים המשרתים בממר"ם משתלבים בתפקידי פיתוח תוכנה, ניהול מערכות מידע, אבטחת סייבר ופיתוח מערכות מתקדמות לצרכים צבאיים. לעיתים קרובות מדובר בפרויקטים בקדמת הטכנולוגיה, המתמקדים בפתרונות חכמים וחדשניים לבעיות מבצעיות מורכבות.
2. חיל המודיעין: עתודאים רבים משתלבים בתפקידי מחקר ופיתוח טכנולוגי ביחידות מובילות בחיל המודיעין, כגון 8200, 81, ויחידות נוספות. במסגרת זו הם עוסקים בפיתוח כלי איסוף מודיעין, ניתוח נתונים (Data Analysis), פיתוח מערכות בינה מלאכותית (AI), וכלי סייבר התקפי והגנתי. מדובר בתפקידים שמשלבים בין ידע מדעי למתן מענה לאיומים מבצעיים מתקדמים.
3. הגנה בסייבר (סייבר צה"ל): במסגרת יחידות ההגנה בסייבר, עתודאים עוסקים בהגנה על מערכות קריטיות של צה"ל מפני מתקפות סייבר. תפקידים אלו כוללים ניתוח חולשות במערכות, פיתוח כלי הגנה מתקדמים, והתמודדות עם אתגרי אבטחת מידע מתקדמים.
4. חיל האוויר (יחידת אופק לדוגמה): עתודאים רבים משתלבים בתפקידי פיתוח טכנולוגי בחיל האוויר, העוסקים במערכות שליטה ובקרה, מערכות ניווט אווירי, ותפעול מערכות מבוססות תוכנה של כלי טיס. חלקם אף מעורבים בפרויקטים חדשניים הקשורים למערכות חלל ולוויינים.
5. היחידה הטכנולוגית של אגף התקשוב וההגנה בסייבר: היחידה הטכנולוגית עוסקת בפיתוח טכנולוגיות חדשניות בתחום התקשורת, מערכות מידע, ומחשוב מבצעי. עתודאים המשרתים כאן נחשפים לעשייה רבת-תחומים, כולל פיתוח רשתות תקשורת, כלי ענן צבאיים, ומערכות תומכות לחימה.
6. פרויקטים משותפים עם התעשיות הביטחוניות: לעיתים קרובות, עתודאים במדעי המחשב משתלבים בשיתופי פעולה בין צה"ל לבין חברות כמו רפאל, אלביט והתעשייה האווירית. במסגרת זו הם מפתחים מערכות מתקדמות כמו כלי טיס בלתי מאוישים, מערכות נשק חכמות, ותוכנות תומכות לחימה.

‍